Helluntaikirkon koulutus toteutuu yhteistyössä Iso Kirja -opiston (IK-opiston) kanssa. IK-opisto on kristillinen kansanopisto, joka palvelee monipuolisesti koko helluntailiikettä. Helluntaikirkko rakentaa erityiskoulutuksia IK-opiston kanssa sekä tarjoaa myös paikallisia ja alueellisia koulutuksia seurakunnille.

Helluntaikirkon järjestämiä koulutuksia ovat työntekijöiden valtakirja- ja vihkikoulutukset sekä evankeliointiin, diakoniaan, koulutyöhön, seurakunnanistutukseen, vankilatyöhön sekä vapaaehtoistyöntekijöiden hyvinvointiin liittyviä koulutuksia.